Isolierung chromosomaler DNA
Methode für tierisches Gewebe
alternative Verfahren für Bakterien | Pflanzen | Hefen | Phagen
Isolieren Sie chromosomale DNA aus tierischem Gewebe nach folgenden Schritten:
- Zentrifugieren Sie bis zu 2 x 109 Zellen in einem Eppendorfreaktionsgefäß: 5 min bei 5000 x g.
- Verwerfen Sie den Überstand und resuspendieren Sie den Zellniederschlag in 180 µl ATL-Puffer.
- Geben Sie 20 µl Proteinase K hinzu.
- Mischen Sie die Probe und inkubieren Sie den Ansatz 30 min bei 55°C.
- Geben Sie 4 µl RNase A (100 mg/ml) hinzu. mischen Sie und inkubieren Sie die Proben für 2 min bei Raumtemperatur.
- Vortexen Sie den Ansatz für 15 sec.
- Geben Sie 200 µl AL-Puffer hinzu und mischen Sie die Lösung.
- Inkubieren Sie die Probe 10 min bei 70°C.
- Geben Sie 200 µl 96-100%-igen Ethanol hinzu. Mischen Sie die Lösung auf dem Vortexer.
- Pipettieren Sie diese Mischung auf eine DNeasy-Säule, die in einem 2 ml Eppendorfgefäß steckt.
- Zentrifugieren Sie 1 min bei 6000 x g. Verwerfen Sie den Durchlauf und das Eppendorfgefäß.
- Stecken Sie das DNeasy-Säulchen in ein frisches 2 ml Eppendorfgefäß. Geben Sie 500 µl AW2-Puffer hinzu.
- Zentrifugieren Sie 3 min bei voller Leistung in der Eppendorfzentrifuge. Verwerfen Sie den Durchlauf und das Eppendorfgefäß.
- Geben Sie das DNeasy-Säulchen in ein frisches, steriles Eppendorfgefäß. Geben Sie 200 µl AE-Puffer auf die Membran des Säulchens und inkubieren Sie bei Raumtemperatur für 1 min.
- Zentrifugieren Sie 1 min bei 6000 x g.
- Geben Sie erneut 200 µl AE-Puffer auf die Membran. Inkubieren Sie erneut 1 min bei Raumtemperatur. Zentrifugieren Sie erneut 1 min bei 6000 x g.
- Führen Sie eine Agarosegelelektrophorese durch, um Ihre Präparation der chromosomalen DNA zu überprüfen. Benutzen Sie dafür ein 0,8%-iges Agarosegel.